Nacionalni park je osnovan 1981 i njime upravlja Javno preduzeće Nacionalni park Kopaonik. Zaštita Parka je obezbeđena primenom Zakona o zaštiti prirode i Zakona o nacionalnim parkovima, kao i određenim brojem međunarodnih konvencija.
Organizacija i vođenje zašticene zone se vrši u skladu sa Regionalnim planom za oblasti posebne namene i drugim relevantnim propisima. Nadzor vrše Ministarstvo za očuvanje prirodne sredine, Ministarstvo za javne radove i Institut za zaštitu prirode.
Zone sa posebno značajnim i retkim biljnim i životinjskim vrstama su izolovani i zaštićeni su kao rezervati.
Postoji 12 takvih rezervata:
- Kozje stene
- Vučak
- Mrkonja
- Jankova bara
- Gobelja
- Barska reka
- Samokovska reka
- Metođe
- Jerak
- Suvo rudište
- Duboka
- Ravnica